RL-SAGE
LongSage robusto (RL-SAGE) es una versión de la serie análisis de la expresión génica SABIO. Es una mejora sobre LongSAGE análisis que está menos avanzado que la última innovación en tecnología de salvia, SuperSAGE.
Mejoras sobre el modelo anterior
RL-SAGE fue desarrollado para resolver varios de los problemas inherentes a SABIO y LongSAGE protocolos, incluyendo pequeños introducir tamaños y baja eficiencia de la clonación. Las mejoras incluyen la capacidad para generar una biblioteca con un tamaño de inserto de 50 ng mRNA, mucho menor que anteriores LongSAGE insertar tamaño de 2 μg mRNA [1]y utilizando un menor número de ditag () reacciones en cadena de polimerasaPOLIMERIZACIÓN EN CADENA) para obtener una completa cDNA Biblioteca. [2]
Experimentos notables
novela de 3.339 genes en Magnaporthe Grisea se identificaron mediante técnicas de RL-SAGE. [3]
Referencias
- ^ Saha, S., et al (2002). "Usar el transcriptoma para anotación del genoma." NAT Biotechnol 20(5): 508-512.
- ^ Gowda, M., et al (2004). "Robusto-LongSAGE (RL-SAGE): un método LongSAGE substancialmente mejorado para análisis del descubrimiento y el transcriptoma del gene." Planta Physiol 134(3): 890-897.
- ^ Gowda, M., et al (2006). "Análisis profundo y comparativo de los transcriptomas de micelio y apresorio de Magnaporthe grisea utilizando métodos MPSS, RL-SAGE y oligoarray." Genómica BMC 7:310.
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