Múltiplex (ensayo)
- Para otros usos de multiplex, ver múltiplex (desambiguación).
A ensayo Multiplex es un tipo de ensayo mide simultáneamente múltiples analitos (docenas o más) en un solo plazo/ciclo de la ensayo. Se distingue de los procedimientos que miden un analito a la vez. Ensayos multiplex dentro de un área de aplicación determinada o una clase de tecnología pueden ser más estratificados basado en cuántos analitos pueden ser medidos por el ensayo, donde "multiplex" se refiere a aquellos con el mayor número de mediciones de analitos por ensayo (hasta millones) y "low-plex" o "mid-plex" se refiere a procedimientos que procesan menos (10s a 1000s), aunque no hay pautas formales para llamar a un procedimiento multi- , mediados- o baja-plex basado en número de analitos medidos. Solo analito ensayos o procedimientos bajo-a-mediados de-plex típicamente son anteriores a la subida de sus versiones multiplex, que a menudo requieren tecnologías especializadas o miniaturización para lograr un mayor grado de paralelización.
Ensayos multiplex son ampliamente utilizados en Genómica funcional experimentos que se esfuerzan para detectar o analizar el estado de todos biomoléculas de una clase dada (por ejemplo, mRNAs, proteínas) dentro de un muestra biológica, para determinar el efecto de un tratamiento experimental o el efecto de un Mutación de la DNA sobre todo de las biomoléculas o vías de en la muestra. La capacidad para realizar tales experimentos de ensayo multiplex gran número de analitos biomolecular de medición ha sido facilitada por la terminación de la secuencia del genoma humano y la de muchos otros organismos modelo.
Contenido
- 1 "Multiplexar" versus "Alto rendimiento"
- 2 Técnicas de ensayo múltiple de ejemplo
- 2.1 Técnicas multiplex basados en ácidos nucleicos
- 2.2 Técnicas multiplex basados en proteínas
- 2.3 Otras técnicas de multiplex
- 3 Referencias
"Multiplexar" versus "Alto rendimiento"
Ensayos multiplex se utilizan a menudo en proyección de alto rendimiento configuración, donde muchos ejemplares pueden ser analizados mediante un análisis multiplex (u otro). Estrictamente hablando, un ensayo múltiple no es necesariamente de alto rendimiento. Cuando la ejecución de un único ensayo multiplex genera datos para un gran número de analitos (por ejemplo, expresión del gen niveles para todos los genes en el ser humano genoma), se considera de alto rendimiento. Sin embargo, es más la capacidad de procesar rápidamente múltiples muestras en forma automatizada que caracteriza técnicas de alto rendimiento. Paralelización masiva de ensayos es una forma de alcanzar el estatus de "alto rendimiento". Otra forma es a través de automatización de la un procedimiento manual del laboratorio.
Técnicas de ensayo múltiple de ejemplo
Técnicas multiplex basados en ácidos nucleicos
- Microarrays de ADN utilizado para expresión del gen o SNP ensayos de detección
- SABIO para la expresión del gen
- Secuenciación de alto rendimiento que puede producir millones de secuencias cortas de ADN paralelamente
- PCR Multiplex para aplicaciones que requieren la amplificación o secuenciación de DNA o RNA
- Amplificación Multiplex sonda de ligadura dependientes (MLPA)
- Secuencia de la DNA por la ligadura
- Luminex/XMAP es grano base de multiplexación, donde cuentas internamente son teñidos con tintes fluorescentes para producir una dirección espectral específica. Biomoléculas (como un oligo o anticuerpo) pueden ser conjugado a la superficie de los granos para capturar los analitos de interés. Esta tecnología utiliza tecnologías de imágenes o de citometría de flujo para la caracterización de los granos así como la detección de emisión ficoeritrina debido a la presencia de analito. La tecnología Luminex permite hasta 500 proteínas o genes para detectar en cada pocillo de una placa de 96 o 384 pocillos, con volumen de muestra muy pequeño. Aplicaciones comunes incluyen citoquinas, marcadores metabólicos y proteínas fosforiladas.
Técnicas multiplex basados en proteínas
- Microarrays de la proteína para la medición de las interacciones proteína-proteína o molécula pequeña que se
- Microarrays de anticuerpos un tipo de matriz de proteína que anticuerpos se vistió
- Exhibición Phage para la detección de bibliotecas grandes proteínas interactúan las proteínas u otras moléculas
- Anticuerpo de perfiles (por ejemplo, múltiples HLA anticuerpos identificación o reactividad predicción contra un panel de la población de donantes de órganos): Luminex/XMAP principio basado en muliplexing se realiza para la identificación de anticuerpos Anti-HLA en muestras de suero donde una mezcla de granos de color-coded luminex está cubierta ya sea de tal manera que individuales (PRA granos) llevan bibliotecas de péptidos HLA de donantes individuales así en combinación simulando una población de donantes (para Anticuerpo reactivo panel o PRA la prueba), o solo antígenos HLA sintéticos purificados capturados en los granos (granos solo antígeno).
- Luminex/XMAP es grano base de multiplexación, donde cuentas internamente son teñidos con tintes fluorescentes para producir una dirección espectral específica. Biomoléculas (como un oligo o anticuerpo) pueden ser conjugado a la superficie de los granos para capturar los analitos de interés. Esta tecnología utiliza tecnologías de imágenes o de citometría de flujo para la caracterización de los granos así como la detección de emisión ficoeritrina debido a la presencia de analito. La tecnología Luminex permite hasta 500 proteínas o genes para detectar en cada pocillo de una placa de 96 o 384 pocillos, con volumen de muestra muy pequeño. Aplicaciones comunes incluyen citoquinas, marcadores metabólicos y proteínas fosforiladas.
Otras técnicas de multiplex
- Microarray de tejido para el análisis de múltiples muestras de tejido
- Microarray celular para la observación de respuestas celulares contra un panel de materiales
- Microarray compuesto químico analizar múltiples compuestos químicos para actividades específicas
- Detección Multiplex permite la detección simultánea de dos o más objetivos en un western blot.[1]
- MULTIPLEX biomarcador Análisis de orina.[2]
- ELISAs son un tipo de análisis que no es multiplex por sí porque cada ensayo detecta un analito individual, pero por lo general es paralela a través de placas de microtitulación para lograr el procesamiento de las muestras de alto rendimiento.
Referencias
- ^ Ambroz K., (2006). "Mejorar la precisión de la cuantificación para western blot".Análisis de imagen 09/2006.[1]
- ^ Laxman B, Morris DS, Yu J et al., (febrero de 2008). "Un análisis de biomarcadores multiplex primera generación de la orina para la detección temprana del cáncer de próstata". Cáncer Res. 68 (3): 645-9. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-3224. PMC2998181. PMID18245462.